1929年11月,白崇禧借廣西局勢混亂之機,隨李宗仁重返廣西,并出任護黨救國軍前敵總指揮一職,中原大戰(zhàn)爆發(fā)后白又改任第一方面軍總參謀長。雖然白所制訂的作戰(zhàn)計劃在戰(zhàn)事一開始就打得湘軍節(jié)節(jié)敗退,但是桂軍并沒能將湘軍擊垮。之后粵軍入湘?zhèn)葥艄疖姡@就使桂軍更難打開局面了。
撤退,只能是唯一的選擇。但是白崇禧在這個時候卻一反常態(tài)地堅持集中兵力,要在衡陽與粵軍決戰(zhàn)。這一提案雖然得到了李宗仁的支持,但并不符合現實,甚至有不少白的擁護者也反對。即便如此,決戰(zhàn)還是打了,結果,自然是敗了,敗得很慘。這就直接促使了黃紹竑的退出,但卻使白崇禧上了位,成了二號人物。
白崇禧適時抓住了各路軍閥不愿與桂軍決戰(zhàn)的想法,堅決主張抵抗,使新桂系避免了滅頂之災,這使他個人的威望達到一個新的高度。兩廣合作后,李宗仁常駐廣州,將桂軍的指揮權下放給白,白就借這個機會排斥異己,并利用自己兼任廣西軍校校長的指揮大力培植親信,使他在不到兩年的時間內,把桂軍整成了支“白家軍”。
那么要不要取代李宗仁成為新桂系的最高領導人呢?白崇禧沒有這么做,因為他心里明白,自己不擅長于政治,與其爭著成為政治領袖,不如借著李的威望專心發(fā)展軍隊,由此開始了李、白合作的蜜月期。需要指出的是,上世紀三十年代中國軍人對戰(zhàn)爭的理解,大部分仍停留在一戰(zhàn)時期的陣地戰(zhàn)模式中,這使國軍在抗戰(zhàn)之初,不能適應新的戰(zhàn)爭模式,導致大量傷亡。白崇禧對于桂軍的訓練同樣如此,導致桂軍在投入到上海戰(zhàn)場時接連發(fā)起無謂的密集沖鋒,遭日軍重創(chuàng)。桂軍在淞滬會戰(zhàn)中不僅損失了大量優(yōu)秀軍官(旅長三名,團長四名),也使其精銳盡喪,很長一段都沒恢復元氣。好在白崇禧經過這次教訓改變了戰(zhàn)爭觀,根據國軍的實際情況提出了新的游擊戰(zhàn)術,并主張“積小勝為大勝”,在很大程度上改變了之后的作戰(zhàn)模式。