鄭文燦在臺大期間就開始與民進黨、尤其是“新潮流系”成員有了密切的接觸。1990年,鄭文燦到《新潮流》雜志社當編輯。1991年7月,鄭文燦加入民進黨,同年,他擔任陳菊等人競選的文宣策劃。當時,鄭文燦借用楊逵小說《壓不扁的玫瑰》,將曾因“美麗島事件”入獄的陳菊喻為“壓不扁的臺灣菊”,助力陳菊最終成功當選。
隨后,在“新潮流系”的安排下,鄭文燦前往家鄉(xiāng)桃園縣扎根歷練。1997年底,鄭文燦當選桃園縣議員,2001年底,鄭文燦擔任民進黨桃園縣長參選人彭紹瑾的競選總部副總干事,負責文宣工作。2004年他又擔任陳水扁競選總部新聞部主任,自此,鄭文燦開始進入黨務系統(tǒng),專營文宣包裝,是民進黨最器重的文宣幕僚之一。
2006年1月,鄭文燦出任臺行政機構新聞部門主管,并兼行政機構發(fā)言人。2007年4月,鄭文燦轉任臺行政機構“政務顧問”,當年10月,出任臺灣海基會副秘書長。
