4月28日，巴斯德研究所發(fā)布新聞公告，該所已完成“法國(guó)輸入性與早期傳播病毒的朔源分析”相關(guān)研究，研究結(jié)果于近日以預(yù)發(fā)表發(fā)布在bioRxiv.org網(wǎng)站。
根據(jù)該研究，法國(guó)暴發(fā)的新冠肺炎疫情并不是由1月份來自中國(guó)的輸入病例引起的，也并非來自意大利，而是來自一種在當(dāng)?shù)貍鞑サ膩碓床幻鞫局辍Ｔ撗芯坑煞▏?guó)國(guó)家呼吸道感染病毒參考中心主任西爾維·范·德維爾和巴斯德研究所RNA病毒進(jìn)化基因組學(xué)負(fù)責(zé)人埃蒂安·西蒙·洛里埃共同牽頭。
根據(jù)巴斯德研究所提供的新聞稿，繼去年12月武漢市出現(xiàn)新冠肺炎疾病后，法國(guó)于1月10日開始病毒監(jiān)測(cè)，由巴斯德研究所和法國(guó)呼吸病毒研究所（NRC）負(fù)責(zé)啟動(dòng)密切關(guān)注流程。
法國(guó)于1月24日發(fā)現(xiàn)首例新冠病毒感染者，這也是歐洲首例新冠肺炎患者，另有其他兩例中國(guó)輸入性病人也很快被檢測(cè)和收治。法國(guó)政府迅速采取措施，追蹤了這些患者的密切接觸者，阻止了病毒的進(jìn)一步傳播。1月份的中國(guó)輸入病例沒有在法國(guó)引發(fā)局部傳播，顯示出法國(guó)采取預(yù)防病毒擴(kuò)散系列措施的有效性。
法國(guó)采集的新冠病毒樣本均儲(chǔ)存在國(guó)家呼吸病毒研究所，巴斯德研究所RNA病毒進(jìn)化基因研究組對(duì)97份法國(guó)病毒樣本進(jìn)行了基因測(cè)序與比對(duì)。
樣本主要為鼻咽拭子和痰液，采樣時(shí)間為1月24日至3月24日。法國(guó)該階段確診病例22302人，死亡1100人，疫情主要流行于法國(guó)北部。
全部樣本均采自于有臨床癥狀的確診患者，同時(shí)將籍貫、旅行史、發(fā)病時(shí)間、病毒載量和采樣部位納入基因比對(duì)內(nèi)容。另有3份來自阿爾及利亞病毒樣本。
法國(guó)3月疫情主要地區(qū)分布圖
法國(guó)新冠肺炎樣本單核酸多態(tài)性發(fā)生部位比較圖
根據(jù)歐洲精準(zhǔn)醫(yī)療平臺(tái)首席科學(xué)家鞠麗雅對(duì)該溯源研究的解讀，圖中顯示：
1、取自法國(guó)東南部并有意大利旅行史的病毒株（GE1583，B2340）與法國(guó)北部的不同，但和意大利北部流行株類似，而且沒有在法國(guó)流行；
2、法國(guó)首例武漢患者（IDF0372），其單核酸多態(tài)性 G22661T是獨(dú)有的，與法國(guó)的所有病毒基因不同；
3、法國(guó)北部地區(qū)的代表性病毒基因?yàn)?GE1973 （東大地區(qū)）， IDF2849（大巴黎地區(qū)） 和 N2223 （諾曼底地區(qū)）；
4、有歐洲旅行史的代表基因?yàn)?IDF2792；
5、3份取自阿爾及利亞的病毒株與法國(guó)北部流行株同源。
巴斯德研究所將法國(guó)檢測(cè)的樣本序列與全球共享流感數(shù)據(jù)倡議組織（GISAID）發(fā)布的338份新冠肺炎病毒序列進(jìn)行比對(duì)和溯源分析，并建立病毒進(jìn)化樹圖譜。
對(duì)比研究表明，法國(guó)流行的新冠病毒和1月發(fā)現(xiàn)的中國(guó)輸入感染病毒并非來自同一毒株，兩種病毒來自同一個(gè)“祖先”，但屬于不同的分支。導(dǎo)致法國(guó)本地疫情的主流分支，和來自中國(guó)和意大利的輸入病例都不相同。
法國(guó)現(xiàn)今流行的病毒樣本中，最早一個(gè)樣本是2月19日從一名患者身上采集的，該患者沒有國(guó)內(nèi)外旅行史，也沒有和海外歸國(guó)的旅行者接觸過。該患者于2月25日去世，隨后法國(guó)出現(xiàn)大規(guī)模疫情潮。
來自不同地區(qū)病毒進(jìn)化樹
鞠麗雅對(duì)科技日?qǐng)?bào)記者表示，從圖中可以看到：
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來自亞太地區(qū)（包括湖北武漢）的病毒株與法國(guó)病毒株沒有關(guān)聯(lián)；
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來自美國(guó)病毒株與法國(guó)的關(guān)聯(lián)不大；
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法國(guó)北部流行病毒株（不同地區(qū)有不同彩色）均出自于同一原始株。
用通俗的話來解釋，法國(guó)新冠病毒是一個(gè)歷史久遠(yuǎn)的大家族，和中國(guó)武漢的病例相隔甚遠(yuǎn)。
綜合上述結(jié)果，巴斯德研究團(tuán)隊(duì)提出，由于最有代表性的基因型的最早病例并沒有旅行史，意味著早在2月份歐洲疫情爆發(fā)之前，已經(jīng)有病毒在法國(guó)和歐洲其他國(guó)家“悄然”流行，且大部分是輕癥或無癥狀，因而長(zhǎng)時(shí)間未被發(fā)現(xiàn)。這項(xiàng)工作為法國(guó)病毒溯源提供了線索，并強(qiáng)調(diào)在無癥狀病例大量存在的情況下，遏制病毒傳播面臨挑戰(zhàn)。
巴斯德研究所指出，許多國(guó)家的病毒取樣工作仍然不完全，因此無法精確估算出法國(guó)新冠病毒的來源或輸入時(shí)間。
蒂安·西蒙·洛里埃指出，“根據(jù)我們的首次觀察，法國(guó)流行的新冠病毒感染與無癥狀病例有關(guān)。對(duì)不同地區(qū)的新冠病毒進(jìn)行測(cè)序很重要，以便能更好地了解法國(guó)新冠病毒的流行軌跡。”
◎ 科技日?qǐng)?bào)駐法國(guó)記者 李宏策
