蔣氏回憶的最后這個細節(jié)特別令人難忘，在如此艱危的情形中，蔣介石居然連一箱珠寶也記得清楚并掛然于心，可見他對這批立足之本的重視程度和考慮的細致入微。除把約10億美元的黃金和銀元連同蔣經(jīng)國后來披露的當時不為外人所知的珍寶秘密運臺外，根據(jù)國民政府訓(xùn)令，科學(xué)教育界能搬遷的人、財、物盡量搬遷，先以臺灣大學(xué)為基地，而后慢慢站穩(wěn)腳跟，以達“求生存、圖發(fā)展”的目的。因臺灣大學(xué)原校長莊長恭履任半年就攜眷悄然向當局呈請辭職開溜，國民政府決定由傅斯年接任臺大校長，著力經(jīng)營關(guān)乎科學(xué)教育這一立國之本的重要基地。經(jīng)蔣介石批準，朱家驊和傅斯年多次晤談，傅勉強表示從命，欲“跳這一個火坑”。

　　1948年11月10日晚，國民政府行政院長翁文灝以故宮博物院理事長身份，召集朱家驊、王世杰、杭立武、傅斯年、李濟、徐森玉等故宮和中博兩院理事在官邸舉行談話會，決定先把當年運往倫敦展覽的精品文物500箱運往臺灣，同時將中央研究院史語所、中央博物院籌備處、中央圖書館等機構(gòu)的主要文物、圖書一并運往臺灣，并由朱家驊向蔣介石呈報，爭取海軍派軍艦押運。

　　11月26日，在南京國民黨中常會擴大會上，派骨干分子陳立夫等人猛烈攻擊教育部長朱家驊鎮(zhèn)壓學(xué)潮不力，當場要其下臺。朱氏心力交瘁、吐血病倒，但在胡適、傅斯年等人的強力支持下，仍咬牙苦撐，堅不去職。幾天后，朱家驊從病床上爬起來，奉命召開“中央研究院在京人員談話會”，由總干事薩本棟主持，分別召集在京的七個研究所負責(zé)人及相關(guān)人員參加。出席會議的有傅斯年、李濟、陶孟和、姜立夫、陳省身、張鈺哲、俞建章、羅宗洛、趙九章等，會議緊急商定了幾條應(yīng)對措施：立即停止各所的基建、擴建工程，原備木料全部制成木箱以備搬遷之需；各所盡快征詢同人意見，做好遷臺準備。眷屬可自行疏散，或于十日內(nèi)遷往上海，可能出國者盡量助其成；南京地區(qū)文物、圖書、儀器、文卷等先行集中上海，由安全小組封存，伺機再南運臺灣等。會議之后，各所組織人員攜公私物資陸續(xù)向上海撤退，“靜觀待變”。